Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Nus1Q99LJ8 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Nus1Q99LJ8 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Nus1Q99LJ8 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Nus1Q99LJ8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Nus1Q99LJ8 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
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Nus1Q99LJ8 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nus1Q99LJ8 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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