Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ciao1Q99KN2 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ciao1Q99KN2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ciao1Q99KN2 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ciao1Q99KN2 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ciao1Q99KN2 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms