Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB6

Foxp3, Forkhead box protein P3, mousemouse

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Length 429 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp3Q99JB6 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Foxp3Q99JB6 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Foxp3Q99JB6 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxp3Q99JB6 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Foxp3Q99JB6 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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