Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddb2Q99J79 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ddb2Q99J79 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ddb2Q99J79 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ddb2Q99J79 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Ddb2Q99J79 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Ddb2Q99J79 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Ddb2Q99J79 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Ddb2Q99J79 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Ddb2Q99J79 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Ddb2Q99J79 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Ddb2Q99J79 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Ddb2Q99J79 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ddb2Q99J79 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ddb2Q99J79 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Ddb2Q99J79 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Ddb2Q99J79 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ddb2Q99J79 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ddb2Q99J79 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ddb2Q99J79 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ddb2Q99J79 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ddb2Q99J79 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ddb2Q99J79 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ddb2Q99J79 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ddb2Q99J79 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ddb2Q99J79 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ddb2Q99J79 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ddb2Q99J79 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ddb2Q99J79 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Ddb2Q99J79 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
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Ddb2Q99J79 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
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