Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Smim11aQ99J19 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Smim11aQ99J19 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Smim11aQ99J19 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Smim11aQ99J19 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim11aQ99J19 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
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