Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
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