Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms