Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rhbdd2Q8VEK2 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rhbdd2Q8VEK2 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms