Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
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