Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Ubxn4Q8VCH8 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Ubxn4Q8VCH8 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Ubxn4Q8VCH8 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Ubxn4Q8VCH8 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Ubxn4Q8VCH8 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Ubxn4Q8VCH8 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Ubxn4Q8VCH8 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Ubxn4Q8VCH8 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Ubxn4Q8VCH8 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ubxn4Q8VCH8 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Ubxn4Q8VCH8 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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