Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3L8

Cdk8, Cyclin-dependent kinase 8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk8Q8R3L8 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk8Q8R3L8 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk8Q8R3L8 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk8Q8R3L8 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdk8Q8R3L8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdk8Q8R3L8 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdk8Q8R3L8 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdk8Q8R3L8 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdk8Q8R3L8 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdk8Q8R3L8 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdk8Q8R3L8 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdk8Q8R3L8 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdk8Q8R3L8 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk8Q8R3L8 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms