Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.06■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MyripQ8K3I4 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms