Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Vrk3Q8K3G5 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Vrk3Q8K3G5 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vrk3Q8K3G5 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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