Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Abcf3Q8K268 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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