Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH72

Trim32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim32Q8CH72 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim32Q8CH72 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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