Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Atg4aQ8C9S8 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atg4aQ8C9S8 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Atg4aQ8C9S8 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Atg4aQ8C9S8 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Atg4aQ8C9S8 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Atg4aQ8C9S8 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Atg4aQ8C9S8 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Atg4aQ8C9S8 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg4aQ8C9S8 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg4aQ8C9S8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg4aQ8C9S8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg4aQ8C9S8 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg4aQ8C9S8 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms