Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8B0

Alx1, ALX homeobox protein 1, mousemouse

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx1Q8C8B0 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Alx1Q8C8B0 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Alx1Q8C8B0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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