Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc113Q8C5T8 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms