Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnot2Q8C5L3 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms