Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hdac7Q8C2B3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hdac7Q8C2B3 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms