Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Atg16l1Q8C0J2 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Atg16l1Q8C0J2 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Atg16l1Q8C0J2 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Atg16l1Q8C0J2 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Atg16l1Q8C0J2 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Atg16l1Q8C0J2 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Atg16l1Q8C0J2 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Atg16l1Q8C0J2 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Atg16l1Q8C0J2 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Atg16l1Q8C0J2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Atg16l1Q8C0J2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg16l1Q8C0J2 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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