Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Snx17Q8BVL3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Snx17Q8BVL3 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms