Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGY9

Slc5a7, High affinity choline transporter 1, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a7Q8BGY9 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Slc5a7Q8BGY9 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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Slc5a7Q8BGY9 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Slc5a7Q8BGY9 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Slc5a7Q8BGY9 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Slc5a7Q8BGY9 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Slc5a7Q8BGY9 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Slc5a7Q8BGY9 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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