Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pcsk9Q80W65 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms