Protein–RNA interactions for Protein: Q80VN0

Cfap100, Cilia- and flagella-associated protein 100, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap100Q80VN0 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfap100Q80VN0 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfap100Q80VN0 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfap100Q80VN0 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfap100Q80VN0 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfap100Q80VN0 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfap100Q80VN0 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfap100Q80VN0 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cfap100Q80VN0 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfap100Q80VN0 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms