Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ube2q1Q7TSS2 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms