Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnf1Q7TSH7 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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