Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms