Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQK5

Ccdc93, Coiled-coil domain-containing protein 93, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc93Q7TQK5 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc93Q7TQK5 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms