Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdcl2Q78Y63 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.1 ms