Protein–RNA interactions for Protein: Q76LS9

Mindy1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy1Q76LS9 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mindy1Q76LS9 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms