Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS6

Sv2c, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2cQ69ZS6 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sv2cQ69ZS6 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sv2cQ69ZS6 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms