Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms