Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms