Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms