Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrhQ62361 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrhQ62361 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrhQ62361 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrhQ62361 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrhQ62361 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrhQ62361 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrhQ62361 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrhQ62361 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TrhQ62361 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms