Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Phox2aQ62066 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms