Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ecm1Q61508 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ecm1Q61508 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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