Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms