Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mre11Q61216 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms