Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms