Protein–RNA interactions for Protein: Q60974

Ncor1, Nuclear receptor corepressor 1, mousemouse

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Length 2,453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncor1Q60974 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Nqo2-203ENSMUST00000220844 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 4930573C15Rik-201ENSMUST00000197707 777 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
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Ncor1Q60974 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Ncor1Q60974 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Ncor1Q60974 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Ncor1Q60974 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Ncor1Q60974 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Tmod3-205ENSMUST00000215821 898 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Zfand4-210ENSMUST00000223495 1751 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Tipin-205ENSMUST00000216594 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ncor1Q60974 Nabp1-206ENSMUST00000188051 680 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms