Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DbpQ60925 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
DbpQ60925 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
DbpQ60925 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DbpQ60925 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DbpQ60925 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DbpQ60925 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DbpQ60925 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DbpQ60925 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DbpQ60925 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
DbpQ60925 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DbpQ60925 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms