Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CttnQ60598 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CttnQ60598 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CttnQ60598 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms