Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

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Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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