Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZF3

Ddx49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddx49Q4FZF3 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx49Q4FZF3 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ddx49Q4FZF3 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx49Q4FZF3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx49Q4FZF3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx49Q4FZF3 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx49Q4FZF3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx49Q4FZF3 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx49Q4FZF3 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx49Q4FZF3 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx49Q4FZF3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx49Q4FZF3 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ddx49Q4FZF3 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx49Q4FZF3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx49Q4FZF3 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx49Q4FZF3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ddx49Q4FZF3 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ddx49Q4FZF3 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ddx49Q4FZF3 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ddx49Q4FZF3 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ddx49Q4FZF3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx49Q4FZF3 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx49Q4FZF3 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ddx49Q4FZF3 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ddx49Q4FZF3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ddx49Q4FZF3 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ddx49Q4FZF3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ddx49Q4FZF3 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ddx49Q4FZF3 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx49Q4FZF3 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx49Q4FZF3 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ddx49Q4FZF3 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddx49Q4FZF3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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