Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms