Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Gngt1-201ENSMUST00000031673 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Il22-201ENSMUST00000096691 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Gm12507-201ENSMUST00000119155 415 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Pbdc1-202ENSMUST00000119477 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Gm15225-201ENSMUST00000120449 1017 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 A230072E10Rik-201ENSMUST00000146161 676 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Gm7967-201ENSMUST00000190991 399 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Gm42619-201ENSMUST00000197564 1136 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Gm43952-201ENSMUST00000203765 751 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 AC158981.3-201ENSMUST00000226844 1024 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 AC154730.1-201ENSMUST00000227874 816 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Olfr921-201ENSMUST00000071681 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Spink11-201ENSMUST00000097587 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrc43Q3V0L5 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms