Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28047Q3US59 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms