Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Skap2Q3UND0 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms